Năm học 2022-2023, huyện Phù Yên có 68 trường học, 1.233 lớp từ bậc học mầm non đến trung học phổ thông, với tổng số hơn 35.000 học sinh; trên 2.000 cán bộ, giáo viên, nhân viên. Năm 2022, huyện đã đầu tư 5,5 tỷ đồng cho 10 đơn vị trường xây dựng, sửa chữa, nâng cấp lớp học, mua sắm thiết bị, đồ dùng dạy và học. Năm học này, toàn huyện có 765 phòng học kiên cố, 311 phòng học bán kiên cố, 29 phòng học tạm, còn 50 phòng học nhờ hoặc mượn.
Hiện nay, các trường học trên địa bàn đang tập trung tận dụng thời gian, vừa bảo đảm hoàn thành chương trình năm học, vừa tổ chức ôn luyện cho học sinh, chuẩn bị tốt nhất cho kỳ thi tốt nghiệp THPT năm 2022.
Sau Tết Nguyên đán Nhâm Dần, số ca dương tính với virus SARS-CoV-2 trên địa bàn huyện Phù Yên tiếp tục gia tăng. Trước diễn biến phức tạp của dịch bệnh, huyện Phù Yên đã chỉ đạo các trường học vừa chủ động thực hiện công tác phòng, chống dịch, vừa đảm bảo chất lượng và chương trình nhiệm vụ năm học 2021-2022.
Trường THPT Gia Phù là một trong 3 trường bậc trung học phổ thông trên địa bàn huyện Phù Yên. Nhà trường có nhiệm vụ thu hút các em học sinh 14 xã vùng lòng hồ và các vùng cao của huyện về học. Năm học này, toàn trường có trên 1.300 học sinh; trong đó có 400 học sinh phải tự túc ở trọ để theo học. Giải pháp bảo đảm an toàn, giúp các em học tập tốt được Nhà trường quan tâm.