Bên cạnh những kết quả đạt được, Nghị định số 123/2020/NĐ-CP về hóa đơn chứng từ đã bộc lộ một số vướng mắc cần được sửa đổi, liên quan đến tình trạng mua bán hóa đơn điện tử.
Tình trạng doanh nghiệp 'ma', trốn thuế vẫn còn diễn biến phức tạp. Việc sửa đổi các quy định trong Nghị định 123/2020/NĐ-CP quy định về hóa đơn, chứng từ mong muốn ngăn chặn tình trạng trên.